تحلیل "pseudotime" یا "زمان کاذب" چیست؟🔹 تحلیل "زمان کاذب" یکی از روش‌های بسیار مهم در تحلیل داده‌ه

تحلیل "pseudotime" یا "زمان کاذب" چیست؟🔹 تحلیل "زمان کاذب" یکی از روش‌های بسیار مهم در تحلیل داده‌های single-cell و به معنی بازسازی مسیر "زمانیِ" تمایز یا تغییر سلول‌ها بر اساس شباهت‌های بیان ژن، بدون اینکه زمان واقعی ثبت شده باشه است.🔹 چرا بهش می‌گن زمان کاذب؟چون ما زمان واقعی نداریم (مثلاً نمی‌دونیم فلان سلول دقیقاً چند ساعت پیش شروع به تمایز کرده)، ولی می‌خوایم ترتیب تغییرات سلولی رو حدس بزنیم. بنابراین، با الگوریتم‌هایی، سلول‌ها رو در یک مسیر فرضی زمانی قرار می‌دیم که نشون بده چه سلولی زودتر و کدوم دیرتر به حالت نهایی رسیده.📌 ابزارهای معروف این نوع تحلیل:🔹 Monocle🔹 Slingshot🔹 SCORPIUS🔹 PAGA (in scanpy)#آنالیز_داده ----------🆔 @BioinfCamp